完整的大豆序列可以揭示隐藏的特性

发表者马特霍普金斯|18 一月 2010

美国印第安纳州西拉斐特——据报道，大豆已成为第一个公布完整基因组序列草图的主要豆类作物环境新闻社.在由能源部, 美国农业部和联合大豆委员会由杰里米·施穆茨 (Jeremy Schmutz) 撰写联合基因组研究所和 HudsonAlpha基因组测序中心, 美国农业部农业研究局 (美国农业部), 普渡大学和北卡罗来纳大学夏洛特分校和来自 18 个机构的 43 名其他研究人员一起，科学家们开始由一个由国家科学基金会.由此产生的基因组序列揭示了迄今为止测序的最复杂的基因组。

大豆基因组包括构成其 46,000 个基因中的 70% 至 80% 基因的重复拷贝。这些基因拷贝散布在整个基因组中，因此特别难以定位。 “如果我要选择一个基因，我可能很难找到该基因的所有必要副本，”大豆基因组论文的通讯作者、普渡大学农学教授斯科特杰克逊说。 “它有很多备份副本。”杰克逊补充说，大豆基因组中的许多重复基因已被改组，因此很难预测基因重复拷贝的位置。此外，大豆基因组包含大量转座因子，称为 TE。这些是可能影响基因表达的移动 DNA 片段，但 TE 很难与基因区分开来。

此前对谷物高粱基因组进行测序的联合基因组研究所表示，大豆测序是其迄今为止所做的最大的植物项目。该序列有望帮助科学家改善大豆特性，它提供了获得第一个亚洲大豆锈病抗性基因的途径。

该研究接下来的步骤之一是对美国种质资源库中的 20,000 个大豆品系进行重新测序，以找到并非所有大豆品种都共有的基因。 “当大豆被驯化时，它们是根据种子大小和其他性状进行选择的，但留下了许多具有潜在价值的基因，”杰克逊说。 “在储存品系中可能存在与蛋白质含量或抗病性相关的有价值基因，而这些基因目前不在栽培品系中。”

“这真的会改变我们在研究中提出有关大豆问题的方式，”爱荷华州立大学美国农业部农业研究中心的研究遗传学家、该论文的合著者兰迪舒梅克说。 “过去需要花费数年的时间，现在可能需要数周或数月。这是前面的整个遗传密码
你的。”