El software se ha utilizado para procesos de mejoramiento asistido por marcadores y de rasgos biotecnológicos para desarrollar líneas de mejoramiento parental de élite e híbridos de sorgo en Brasil.
Bayer CropScience ha adquirido una licencia de varios años para utilizar el software de visualización del genoma desarrollado por Ceres Inc., la empresa de biotecnología agrícola anunció hoy en un presione soltar.
The company’s Persephone software allows researchers to analyze large amounts of genetic data on macro and micro levels, from chromosomes to individual DNA building blocks. Much like how geographic information systems (GIS) mapping software allows users to add weather, traffic or other information to a geographic map, Persephone users are able to add layers and cross reference related information on top of the genetic data that the software gathers.
“La explosión de la secuenciación de ADN del genoma completo de bajo costo, desde la ciencia vegetal hasta la investigación biomédica, está creando conjuntos de datos increíblemente grandes que son fuentes ricas de información si se extraen de manera efectiva”, dijo el presidente y director ejecutivo de Ceres, Richard Hamilton.
"Nuestra empresa se beneficiará de la implementación de esta solución integrada, ya que esta plataforma permite consultas interactivas y visualización integrada de varios datos ómicos", dijo el Dr. Jakob de Vlieg, director del grupo de Ciencias de la vida computacional de Bayer CropScience.
Tim Swaller, vicepresidente de tecnologías genómicas de Ceres, señaló que la velocidad es muy importante porque el mercado de la genética ha luchado con conjuntos de datos masivos generados por la secuenciación de ADN y las pruebas genéticas que consumen mucho tiempo. Por ejemplo, un genoma típico contiene varios terabytes de datos. Los genomas de plantas, que pueden ser más grandes que el genoma humano, han sido algunos de los más desafiantes. La compañía ha utilizado este software en sus canales de mejoramiento asistido por marcadores y rasgos biotecnológicos para acelerar el desarrollo de líneas de mejoramiento parental de élite e híbridos mejorados de sorgo para Brasil. Espera tener una versión basada en la nube disponible en un futuro próximo.